公元前1500年之后不久，迈锡尼人取代米诺斯人成为爱琴海世界的统治者，尽管他们无法完全弄清这是如何发展的。这或者是由于克里特岛发生了一场大地震，大大削弱了该地的力量，致使大陆人乘虚而入控制了该岛，或者是由于迈锡尼人已经变得非常强大，有力量迅速征服克里特。不论情况如何，在约公元前1500至1400年间，迈锡尼人对克里特一段时期的繁荣和艺术成就负有责任。

然而在公元前1400年左右，又一股希腊入侵者越海到了克里特，毁灭了克诺索斯，彻底结束了迈锡尼文明。这一入侵为何具有如此大的毁灭力，至今尚不清楚，不过希腊大陆在以后二百年间成了爱琴地区的主导力量，没有敌手可与之抗衡。公元前1250年左右，迈锡尼人与小亚细亚西部的特洛伊人进行了战争并取得了胜利，但他们自己现在也濒临灭亡。

在公元前1200至1100年这一百年间，迈锡尼臣属于多里安人——多里安人是一拥有铁制武器的野蛮的北希腊人。(铁制武器在一开始也许不比迈锡尼人使用的青铜武器优越太多，但是由于西亚和东欧铁矿比青铜所需的铜和锡分布要广，因而铁制武器更为便宜，可为更多的战士所拥有)。由于多里安人除其武器外在各方面都不开化，因而他们取得支配地位就开始了希腊历史的一个黑暗时代，它一直持续到约公元前800年。

米诺斯文明和迈锡尼文明的重要性主要不能根据它们对后世的影响来加以评估。除迈锡尼人外，米诺斯文化对其他民族几乎没有影响，随后在约公元前1400年之后被毁，几乎踪迹全无。迈锡尼留下的遗迹稍多一些，但仍为数不太多。后世希腊人保留了一些迈锡尼的男女神袛，比如宙斯、赫拉、赫耳墨斯和波塞冬，但完全改变了他们在宗教万神殿中的地位。

另外，后世希腊人可能从迈锡尼文化中承袭了对体育的爱好及其度量衡制度，但其间的关连似待弄清。荷马无疑记得迈锡尼人对特洛伊成功的围困，但同样重要的是应认识到荷马忘掉了多少：荷马(实际上有作品传流至今的一些不同的作家用的都是这一名字)在公元前8世纪创作时完全忘掉了我们从线形文字B文书中了解到的迈锡尼官僚君主政治的整个类型。

迈锡尼人和后世希腊人之间的这一中断也许不无好处。一些史学家坚称，专制的迈锡尼被多里安人毁灭是后世更自由、更开明的希腊观点产生的不可缺少的一步。