海绵肾里面有好多结石一般是由尿液中的矿物质沉积、尿液浓缩、尿液pH值异常等原因引起的，可采用药物治疗、体外冲击波碎石术和手术等方式进行治疗，详情如下：

1. 药物治疗：适用于结石直径小、位置比较靠近肾脏表面、无严重症状的患者。药物治疗可以通过调整尿液的化学成分，促进结石溶解或减少结石的形成。对于尿酸结石，可以使用碱化尿液的药物；对于钙结石，可以使用草酸钠、柠檬酸等药物。但药物治疗需要长期坚持，治疗过程较长。

2. 体外冲击波碎石术：适用于结石直径较大、数量较多、症状明显的患者。该治疗方式通过体外产生冲击波，将结石粉碎成小颗粒，然后由尿液排出体外。体外冲击波碎石术是一种无创伤的治疗方法，对患者的身体损伤较小，但治疗过程中可能会出现疼痛、血尿等不适症状。

3. 手术治疗：适用于结石较大、位置较深、无法通过其他治疗方式进行有效碎石的患者。手术治疗可以通过直接切开肾脏或腹腔进行结石的摘除。手术治疗具有直接、彻底的效果，适用于复杂、严重的结石病例。但手术治疗需要进行麻醉，手术风险较大。

除以上相对常见的治疗方式外，还有其他的治疗方式，比如内镜下气囊扩张碎石术，适用于结石较小、位置较深的患者；腔镜手术，适用于复杂的结石病例；以及尿路激光碎石术等，具体适用情况需要根据患者具体情况来确定。