慢性功能性便秘一般是由多种因素引起的，可采用药物治疗、行为疗法和生活方式改变等方式进行治疗，详情如下：

1. 药物治疗：药物治疗是治疗慢性功能性便秘的常见方式之一。常用的药物有泻药、益生菌和渗透性药物。泻药可刺激肠道蠕动，促进排便；益生菌可调节肠道菌群平衡，改善便秘；渗透性药物可增加肠腔内水分，软化粪便。药物治疗适用于轻度到中度便秘症状明显的患者。

2. 行为疗法：行为疗法包括建立规律的排便习惯、适度增加运动和进行骨盆底肌肉训练等。建立规律的排便习惯可以通过每天固定时间段去上厕所，养成良好的排便习惯；适度增加运动可以刺激肠道蠕动，促进排便；骨盆底肌肉训练可以增强盆底肌肉的收缩力，改善排便困难。行为疗法适用于轻度到中度便秘症状不明显的患者。

3. 生活方式改变：生活方式改变是治疗慢性功能性便秘的基础措施。包括增加膳食纤维摄入量、充足饮水、保持规律的饮食和生活习惯等。增加膳食纤维摄入量可以增加粪便体积，促进肠道蠕动；充足饮水可以保持粪便柔软，便于排便；保持规律的饮食和生活习惯可以帮助建立稳定的肠道功能。生活方式改变适用于轻度便秘症状不明显的患者。

除以上相对常见的治疗方式外，还有其他的治疗方式，比如中医中药、针灸和物理治疗等，适用于对药物治疗和行为疗法无效的患者或需要综合治疗的患者。中医中药可以通过调理气血、活血化瘀来改善便秘；针灸可以刺激神经系统，调节肠道功能；物理治疗可以通过电刺激、热疗等手段促进肠道蠕动。但这些治疗方式的疗效需要进一步证据支持，具体适用情况需根据患者具体情况而定。