健身肩关节疼痛一般是由过度使用、肌肉不平衡等原因引起的，可采用休息、物理治疗和药物治疗等方式进行治疗，详情如下：

1. 休息：当肩关节疼痛发作时，适当休息是治疗的首要方法。休息可以减轻肩关节的负担，帮助肩关节恢复。在休息期间，避免进行肩部负重的活动，避免过度使用肩关节，以便给肩关节足够的时间进行修复。

2. 物理治疗：物理治疗可以帮助缓解肩关节疼痛并增强肩部肌肉的稳定性。常用的物理治疗方法包括热敷、冷敷、按摩、理疗和针灸等。热敷可以促进血液循环，缓解肌肉痉挛和疼痛；冷敷可以减轻炎症和肿胀；按摩可以舒缓肩部肌肉的紧张和疼痛；理疗和针灸可以刺激特定的穴位，促进肩关节的康复。

3. 药物治疗：药物治疗可以缓解肩关节疼痛和炎症。常用的药物包括非甾体消炎药（如布洛芬和对乙酰氨基酚）和局部外用的止痛药膏。非甾体消炎药可以减轻关节炎引起的疼痛和炎症；止痛药膏可以直接作用于肩部，缓解疼痛和肌肉紧张。

除以上相对常见的治疗方式外，还有其他的治疗方式，比如肩关节针灸、肩关节注射和手术治疗等，适用于疼痛严重、无法缓解或病因明确的情况。肩关节针灸可以刺激特定穴位，促进肩关节的康复；肩关节注射可以直接向肩关节注射药物，缓解炎症和疼痛；手术治疗适用于严重损伤或肩关节退行性疾病的情况下，可以通过手术修复或替换肩关节。