慢性自主神经功能障碍一般可采用药物治疗、心理疗法和生活方式调整等方式进行治疗，详情如下：

1.药物治疗：药物治疗是治疗慢性自主神经功能障碍的常用方法之一。针对患者的症状和病情，可以选用抗焦虑药物、抗抑郁药物、β受体阻滞剂等药物进行治疗。适用于症状明显、需要迅速缓解的患者，或伴有明显的情绪障碍和自主神经症状的患者。

2.心理疗法：心理疗法是通过心理咨询、认知行为疗法等方法帮助患者调整情绪、改变不良的心理态度和行为习惯，以减轻自主神经功能障碍的症状。适用于患者存在明显的心理压力、焦虑、抑郁等情绪问题的情况下，可以通过心理疗法来缓解症状。

3.生活方式调整：慢性自主神经功能障碍的治疗中，生活方式调整也是非常重要的一环。患者可以通过改善饮食习惯、增加运动、保持良好的睡眠质量、避免过度疲劳等方式，调整生活方式，有助于缓解症状。适用于患者症状较轻、无严重心理问题的情况下，可以通过生活方式调整来改善自主神经功能障碍。

除以上相对常见的治疗方式外，还有其他的治疗方式，比如针灸、按摩等。针灸适用于患者自主神经功能紊乱明显，有明显的症状表现的情况下，可以通过针灸来调整自主神经功能。按摩适用于患者肌肉紧张、疼痛明显的情况下，可以通过按摩来缓解肌肉紧张和疼痛症状。具体的治疗方式需要根据个体情况来确定。