泌尿系统沙眼衣原体阳性一般是由感染等原因引起的，可采用抗生素治疗、局部药物治疗和免疫调节治疗等方式进行治疗，详情如下：

1. 抗生素治疗：抗生素是治疗泌尿系统沙眼衣原体阳性的常用方法之一。根据药敏试验结果，选择适当的抗生素进行治疗。常用的抗生素包括喹诺酮类、大环内酯类和四环素类等。抗生素能有效杀灭衣原体，缓解症状，并减少传播。适用于轻度和中度感染，或合并其他细菌感染的情况。

2. 局部药物治疗：局部药物治疗主要是指眼部使用抗生素眼药水或眼膏。这种治疗方式能够直接作用于受感染的部位，加速炎症的消退。抗生素眼药水或眼膏通常每日使用3-4次，持续治疗1-2周。适用于泌尿系统沙眼衣原体阳性引起的结膜炎、角膜炎等眼部感染。

3. 免疫调节治疗：免疫调节治疗是指通过增强机体免疫力来抑制病原体的生长和繁殖。例如，口服免疫调节剂如金银花提取物、草莓酸和维生素C等，能够提高机体的抵抗力，减少病原体的感染。适用于泌尿系统沙眼衣原体阳性引起的泌尿系统感染。

除以上相对常见的治疗方式外，还有其他的治疗方式，比如中药治疗。中药治疗可以根据病情的不同选择适当的中药方剂，如金银花、连翘、黄连等具有抗菌和抗炎作用的中药。适用于轻度感染，或对抗生素过敏的患者。但需要注意的是，中药治疗应在医生的指导下进行，避免不当使用导致不良反应。