CT和肠镜的主要区别在于检查方法不同。

1. CT（计算机断层扫描）是一种非侵入性的影像学检查方法，通过X射线扫描身体部位并生成断层图像，能够全面观察身体内部的器官和结构。而肠镜是一种侵入性的检查方法，通过将一根灵活的管状器械（肠镜）插入直肠，进而观察和检查结肠和直肠的内部情况。

2. CT可以对全身进行扫描，能够检测和评估各种疾病，包括肠道疾病以外的其他病变，如肿瘤、骨折等。而肠镜主要用于检查结肠和直肠部位，对其他身体部位的病变无法直接观察。

3. CT检查时间相对较短，通常只需几分钟至数十分钟不等，而肠镜检查时间较长，通常需要30分钟至1小时左右，取决于患者肠道情况和检查的深度。

4. CT不需要进行肠道准备，患者可以正常进食和排便，而肠镜检查需要进行肠道准备，包括清洁肠道和空肠，以确保检查的准确性。

5. CT是一种无痛的检查方法，患者通常只需要躺在检查床上，不会感到明显的不适。而肠镜检查可能会有些不适和轻微的疼痛感，因为插入肠镜可能会导致肠道轻微刺激和蠕动。

需要注意的是，选择CT还是肠镜检查应该根据医生的建议和具体病情来决定。CT广泛用于全身各部位的疾病检查，而肠镜主要用于结肠和直肠的疾病诊断和治疗。在某些情况下，医生可能会建议同时进行CT和肠镜检查，以获得更准确的诊断结果。