细菌性肠胃炎和病毒性肠胃炎的主要区别是前者由细菌感染引起，后者由病毒感染引起。

1. 引起肠胃炎的病因不同：细菌性肠胃炎是由细菌感染引起的，常见的病原体包括沙门菌、大肠杆菌等；而病毒性肠胃炎是由病毒感染引起的，常见的病毒包括诺如病毒、轮状病毒等。

2. 症状表现不同：细菌性肠胃炎常伴有腹痛、腹泻、恶心、呕吐等症状，严重时可能出现发热、血便等；而病毒性肠胃炎的症状通常较轻，主要表现为腹泻、恶心、呕吐，一般不伴有发热。

3. 潜伏期不同：细菌性肠胃炎的潜伏期较长，通常为几个小时至数天；而病毒性肠胃炎的潜伏期较短，一般为数小时至数天。

4. 治疗方法不同：对于细菌性肠胃炎，通常需要使用抗生素治疗，以清除体内的细菌感染；而病毒性肠胃炎目前没有特效药物可用，通常只能进行对症治疗，如保持充足的水分和营养摄入，以帮助身体恢复。

5. 传播途径不同：细菌性肠胃炎主要通过食物、水源或接触感染者的粪便传播；而病毒性肠胃炎主要通过飞沫传播、接触传播和食物污染传播。

需要注意的是，细菌性肠胃炎和病毒性肠胃炎都属于常见的肠胃疾病，但治疗方法和预防措施略有不同。在患病期间，应注意饮食卫生，避免食用生冷、不洁食物，并加强个人卫生习惯，如勤洗手等。如果出现严重症状或持续不缓解，应及时就医。