男性衣原体阳性一般是由性接触传播等原因引起的，可采用抗生素治疗、中药治疗以及免疫调节治疗等方式进行治疗，详情如下：

1. 抗生素治疗：适用于男性衣原体感染较为严重或症状明显的情况下。常用的抗生素包括阿奇霉素、多西环素等，可以通过口服或注射的方式进行，具有较好的治疗效果。一般治疗周期为1-2周，具体剂量和疗程需要根据医生的建议来确定。

2. 中药治疗：适用于轻度或无症状的男性衣原体感染。中药治疗可以通过调理体内的阴阳平衡，促进免疫系统的功能恢复，从而达到抑制衣原体生长的目的。常用的中药有金银花、苦参等，可以通过口服或外用的方式进行治疗。治疗周期一般较长，需要根据具体情况进行调整。

3. 免疫调节治疗：适用于复发性或慢性男性衣原体感染。免疫调节治疗可以增强机体的免疫力，提高对衣原体的抵抗能力，从而预防和控制感染的发生。常用的免疫调节治疗方法有免疫增强剂、免疫调节剂等，具体的用药和剂量需要根据医生的指导来确定。

除以上相对常见的治疗方式外，还有其他的治疗方式，比如局部抗菌药物的使用，适用于衣原体感染局部化且症状较轻的情况。此外，个体差异较大，针对不同的患者，医生可能会采用个体化的治疗方案，例如联合用药、物理治疗等，以提高治疗效果和降低复发率。在治疗过程中，患者还需注意个人卫生，避免性行为传播，保持充足休息，均衡饮食，增强自身免疫力。