肝脏时空图谱有助于解析肝脏损伤与再生复杂机制。
深圳商报首席记者 袁静娴
作为人体的“化工厂”,肝脏除了解毒功能外,还具备代谢、合成、消化、免疫等多种功能。肝病的发展往往表现出空间异质性,肝脏损伤后的再生模式也与其空间位置高度相关。在空间维度上解析控制肝细胞损伤与再生的机制,对于阐明肝脏疾病恶性转化和再生医学具有重要意义。
4月16日,杭州华大生命科学研究院与中国科学院分子细胞科学卓越创新中心主导,联合吉林大学、广州医科大学第五附属医院等国内外机构,在国际期刊《自然·遗传学》(Nature Genetics)发表了两篇研究成果。
研究利用华大自研高精度大视场时空组学技术Stereo-seq和单细胞转录组测序技术DNBelab C4,构建了全面的小鼠肝脏高精度时空图谱,分别揭示了小鼠肝脏稳态的空间分子特征,以及肝部分切除、胆汁淤积损伤与修复过程中的复杂分子机制。两项研究从不同角度解析了肝脏损伤与再生复杂机制,有望为肝脏疾病治疗、肝脏再生与移植提供新的思路和策略。
肝小叶是哺乳动物肝脏结构和功能的基本单元,成人肝脏由50万到100万个肝小叶组成。在每个肝小叶中,血液从门脉区流向中央静脉区,其营养物质、激素、细胞、生长因子等呈现梯度变化,导致肝小叶不同空间位置上的细胞具有不同的生物学功能。
基于Stereo-seq技术,由杭州华大生命科学研究院主导的研究团队,探索了肝脏稳态和肝部分切除再生的机制。
首先,研究团队对正常的肝脏和70%切除之后的肝脏开展研究,以纳米级别的空间分辨率构建了连续的肝小叶网络,揭示了小鼠稳态肝脏中的细胞类型、基因表达和微环境信号的空间特征,以及部分肝切除后对应的时空动态变化如何协调准确的肝再生。
研究团队在门静脉-中央静脉轴上解析了不同位置肝细胞的基因功能分布特征,并识别出一系列具有区域化分布的基因,例如,甲状腺激素受体在中间区域高表达,乙肝病毒受体在中央静脉附近高表达,肝细胞增殖抑制因子在两端高表达。这一发现将帮助研究者更好地认识肝脏疾病的空间易感性差异。
此外,研究团队首次发现肝脏中存在约50-200微米的免疫微结构,对其进行了定位并解析了其中的免疫细胞组成,发现主要由T细胞和单核细胞组成。研究团队推测其可能是肝脏免疫响应的特殊机制,可协助肝脏抵御外源细菌或抗原。这一发现丰富了对肝脏免疫微环境的认识。
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